Как известно, в Prototype 2 нам будет представлено три различные зоны, разделяющие город по уровню заражения. В зеленой зоне люди живут практически нормальной жизнью, желтая просто переполнена военными, пытающимися контролировать распространение вируса, а красная – реальный ад, где практически нет неинфицированных людей.
В небольшом видеодневнике разработчики Prototype 2 рассказывают, что решили создать три различные зоны для разнообразия в геймплее и визуальном оформлении. Кампания начинается в желтой зоне, однако по мере прохождения игры главный герой получает доступ и в остальные локации, после чего может свободно перемещаться между открытыми зонами для выполнения побочных заданий и улучшения достигнутых ранее результатов.