В сети был опубликован второй дневник разработчиков проекта ZombiU, в котором рассказывается о сюжете и локациях. Все действия развиваются вокруг Черного Пророчества – апокалиптическое событие было предсказано 400 лет назад неким человеком по имени Джон Ди. К сожалению, никто не потрудился предотвратить предсказанное бедствие... или пытался, но не смог?
Ключевые роли в сюжете играют три персонажа. The Prepper – бывший военный, который помогает игроку через камеры видеонаблюдения и обучает необходимым навыкам выживания. Второй персонаж – Сандра. Она является главой тайного сообщества, именуемого Вороны Ди – они пытаются спасти как можно большее количество людей. Последним будет доктор Найт, который ищет лекарство от распространившейся по городу заразы.